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합성 RNA로 검증한 poly(A) tail 길이 추정

🔎 왜 poly(A) tail 길이를 정확히 재야 할까요?mRNA의 poly(A) tail 길이는 전사체 안정성, 번역 효율, 아이소폼 조절과 직결됩니다. ONT의 직접 RNA 시퀀싱은 역전사·증폭 없이 원신호에서 poly(A) 구간을 포착하므로, 전장 전사체와 tail 길이를 단일 분자 수준에서 함께 읽을 수 있습니다. 본 연구는 이러한 강점을 활용해 정답(ground truth)이 알려진 합성 RNA로 길이 추정 도구를 체계적으로 비교했습니다. 🧪 연구 설계: 합성 표준으로 공정하게 벤치마크하다데이터셋: Sequin(정답 30 nt·60 nt)과 eGFP IVT(10·30·40·60·100·150 nt).도구: 신규 딥러닝 BoostNano, 기존 tailfindr, nanopolish, Dora..

PaperReviews/Omics 2025.09.14
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