PacBio×EpiCypher, Fiber-seq 상용화 가속

PacBio(퍼시픽 바이오사이언스)와 EpiCypher가 단일분자 멀티옴 분석인 Fiber-seq를 위한 핵심 효소 Cutana Hia5의 공동 마케팅 협력을 발표했습니다. 이로써 EpiCypher는 PacBio Compatible 파트너에 합류했고, 연구자는 PacBio HiFi 시퀀싱과 함께 Hia5를 구매·활용할 수 있으며, Cutana Fiber-seq 분석 서비스의 얼리액세스도 이용할 수 있습니다. 재무 조건은 비공개입니다.

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🔎 한눈에 보기

• 무엇이 바뀌나? PacBio가 Hia5 효소를 Fiber-seq용으로 공동 마케팅하고, EpiCypher는 Fiber-seq 서비스(얼리액세스)를 개시합니다.
• 왜 중요한가? 한 분자의 리드에서 크로마틴 접근성·DNA 메틸화·유전변이를 동시에 읽어, 유전변이와 조절기작을 한 번에 연결할 수 있습니다.
• 공식 코멘트: PacBio 마케팅 총괄 David Miller는 “Fiber-seq가 희귀질환 메커니즘 규명과 신약 발견 가속에 기여한다”고 밝혔습니다.

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🧬 Fiber-seq란? (개념 설명)

Fiber-seq는 세포 핵 내 접근 가능한 DNA에 Hia5 메틸트랜스퍼레이스로 비유카리오틱 표지(m6A)를 ‘스텐실’처럼 찍은 뒤, PacBio HiFi로 읽어 염기서열·접근성·뉴클레오솜/TF 흔적을 단일 분자 스케일에서 동시에 추출하는 방법입니다. 해당 기술은 워싱턴대 Stergachis 연구실에서 고안되었습니다.

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🚀 이번 협력의 포인트

• 상용화 가속: Hia5가 상용 포맷으로 제공되고 EpiCypher의 서비스 옵션이 더해져, 초기 도입 장벽이 낮아집니다.
• 짧은 리드의 한계 극복: 길고 정확한 HiFi 리드로 복잡·반복 구간의 조절지도를 연속 컨텍스트에서 확인합니다.
• 워크플로우 통합: 여러 실험을 한 번의 장독해 시퀀싱으로 통합해 시간·비용을 절감합니다.
• 제품 정보: Hia5는 8·24회 반응 포맷으로 제공되며 프로토콜이 함께 지원됩니다.

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🧪 워크플로우 이해하기

1. Hia5 처리로 접근 가능한 DNA에 m6A 표지
2. PacBio HiFi로 길고 정확한 단일분자 리드 획득
3. m6A 호출 + 염기서열 동시 해석으로 접근성·뉴클레오솜/TF·변이를 한 번에 프로파일링
4. 결과적으로 유전변이 ↔ 조절 상태를 하나의 분자 단위에서 직접 연결합니다.

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🏥 적용 가능성 (연구·정밀의학)

• 희귀질환 연구: 드문 변이와 비번역 조절부위의 기능적 영향 연결에 유리합니다.
• 암·복잡 유전체 구간: 반복서열, 구조변이가 많은 영역의 조절지형을 고해상도로 파악합니다.
• 표적 발굴·검증: 단일분자 수준의 크로마틴 상태로 후보 표적의 생물학적 타당성 평가를 정교화합니다.

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🖼️ 관련 그림 (개념 이해용)

• 그림 1. Fiber-seq 개요 스키마(스텐실 표지 → HiFi 판독) — Stergachis 연구실 소개 페이지 이미지.
• 그림 2. PacBio HiFi 시퀀싱 원리(원형 라이브러리·반복 판독 → HiFi 리드) — PacBio HiFi 소개 페이지 다이어그램.

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📣 공식 발표 하이라이트

• PacBio Compatible 합류: EpiCypher가 공식 파트너로 등재되어 호환성·지원성이 강화되었습니다.
• 공식 코멘트: “PacBio 시퀀싱의 에피지놈 연구 역할을 진전시키는 중요한 단계”라는 PacBio 측 발언과, “단일분자 멀티옴의 새로운 시대”라는 EpiCypher 측 발언이 소개되었습니다.

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🧭 왜 지금 중요한가? (의의와 전망)

Fiber-seq의 상용화 생태계가 갖춰지면서, 연구실 수준의 기법이 재현성·공급 안정성·서비스 접근성을 확보하게 되었습니다. 이는 짧은 리드 기반 에피지노믹스의 단절된 컨텍스트를 넘어, 한 분자 내에서 유전정보와 조절정보를 통합해 해석하는 표준을 확산시킬 것으로 기대됩니다. 특히 희귀질환·암 분야에서 유전변이의 기능적 해석과 정밀의학 연구가 가속될 가능성이 큽니다.

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✅ 한줄평

Hia5 표지와 HiFi 시퀀싱을 결합해 단일분자 멀티옴의 실용화를 한 단계 끌어올린 협력 소식입니다.

 

참고자료

• PacBio 보도자료 및 재배포 기사1, 재배포 기사2
• EpiCypher 블로그/서비스 페이지
• Fiber-seq 방법론 논문 및 적용 사례